contextsv.h

Go to the documentation of this file.

//
// contextsv.h:
// Main class for ContextSV
//
 
#ifndef CONTEXTSV_H
#define CONTEXTSV_H
 
#include "input_data.h"
#include "cnv_data.h"
#include "sv_data.h"
 
 
class ContextSV {
    private:
        InputData* input_data;
 
        // Label SVs based on CNV calls
        void labelCNVs(CNVData cnv_calls, SVData& sv_calls);
 
    public:
        ContextSV(InputData& input_data);
 
        // Entry point
        int run();
};
class ContextSV {…};
 
#endif  // CONTEXTSV_H